Microarray detection and characterization of bacterial foodborne pathogens

این مروری بر پیشرفت‌های اخیر در استفاده از ریزآرایه DNA برای تشخیص پاتوژن‌های منتقله از غذا است. تشخیص و شناسایی سریع پاتوژن های غذایی برای ایمنی مواد غذایی حیاتی است. بسیاری از فناوری های مرتبط تا به امروز به شدت توسعه یافته اند. فناوری ریزآرایه DNA راه جدیدی را برای ایمنی مواد غذایی شامل تشخیص و شناسایی عوامل بیماری زا ارائه می دهد. ریزآرایه DNA می تواند برای تشخیص و شناسایی عوامل بیماری زا با تجزیه و تحلیل الگوهای هیبریداسیون بین پروب های جذب و اسیدهای نوکلئیک جدا شده از نمونه های غذا یا باکتری ها استفاده شود. این امکان تشخیص سریع، دقیق و مقرون به صرفه‌تر پاتوژن‌ها را در مقایسه با روش‌های سنتی کشت یا سنجش ایمنی فراهم می‌کند. استفاده از ریزآرایه‌های DNA برای باکتری‌های مختلف موجود در مواد غذایی، مانند کمپیلوباکتر، سالمونلا، لیستریا مونوسیتوژنز، یا اشریشیا کلی تولیدکننده سم شیگا، شناسایی سریع و شناسایی ویژگی‌های ژنتیکی آن‌ها (مانند مقاومت ضد میکروبی، حدت) را بهبود می‌بخشد. از آنجایی که بیماری‌های ناشی از مواد غذایی باکتریایی تهدیدات جدی‌تری برای مراقبت‌های بهداشتی عمومی ایجاد می‌کنند، توسعه روش‌های سریع و دقیق برای تشخیص و شناسایی عوامل بیماری‌زا برای کنترل مناسب آنها در اولین زمان حیاتی است.

This is a review of recent advances on the use of DNA microarray for diagnosing foodborne pathogens. Rapid detection and characterization of foodborne pathogens is critical for food safety. Many relevant technologies have been intensively developed to date. DNA microarray technology offers a new way to food safety involving pathogen detection and characterization. DNA microarray can be used for detection and characterization of pathogens by analyzing hybridization patterns between capture probes and nucleic acids isolated from food samples or bacteria. It allows more rapid, accurate, and cost-effective detection of pathogens compared with traditional approaches of cultivation or immuno-assays. The application of DNA microarrays to different foodborne bacteria, such as Campylobacter, Salmonella, Listeria monocytogenes, or Shiga toxin producing Escherichia coli, will improve their rapid identification and characterization of their genetic traits (e.g., antimicrobial resistance, virulence). As bacterial foodborne diseases are posing more serious threats to public healthcare, development of rapid and accurate methods for pathogen detection and characterization is critical to their proper control at the earliest time.