Protein Stability and Folding: A Collection of Thermodynamic Data

تاخوردگی پروتئین یکی از منحصر به فردترین مشکلات بیوشیمی مدرن است. تجزیه و تحلیل ساختار دسترسی به ثروت معماری مولکولی پروتین ها را فراهم کرده است. از آنجایی که معماری به محاسبات ثابت نیاز دارد، ساختار پروتئین همیشه به عوامل ترمودینامیکی که بر تاخوردگی و پایداری یک پروتئین تاخورده خاص بر روی زنجیره پلی پپتیدی غیر سازمان‌یافته حاکم هستند، مرتبط است. در طول دهه‌های گذشته حجم عظیمی از داده‌های ترمودینامیکی مربوط به تاخوردگی و پایداری پروتئین جمع‌آوری شده است. داده‌ها مطمئناً در رفع مشکل تاخوردگی پروتئین اهمیت دارند. در عین حال، داده‌ها می‌توانند ساخت پروتئین‌های اصلاح‌شده و تازه سنتز شده با خواص بهینه‌سازی شده برای کاربردهای خاص را راهنمایی کنند. هدف این کتاب تولید مجموعه‌ای از داده‌ها است که حجم وسیعی از داده‌های موجود را برای تحقیقات چند رشته‌ای که در آن شیمی، فیزیک، زیست‌شناسی و پزشکی و همچنین تحقیقات و فناوری دارویی و غذایی درگیر هستند، در دسترس قرار می‌دهد. چندین سال طول کشید تا همه داده‌ها جمع‌آوری شوند و نویسنده مایل است از همه کسانی که داده‌ها، ایده‌ها یا حتی نتایج منتشر نشده را ارائه کردند تشکر کند. نویسنده به ویژه مدیون پروفسور Wadso (لوند، سوئد) و کمیته راهبری IUPAC در شیمی فیزیکی زیستی است. علاوه بر این، پشتیبانی Deutsche Forschungsgemeinschafi (INK 16 AI-I) تایید شده است.

Protein folding remains one of the most exclusive problems of modern biochemistry. Structure analysis has given access to the wealth of the molecular architecture of pro­ teins. As architecture needs static calculations, protein structure is always related to thermodynamic factors that govern folding and stability of a particular folded protein over the non-organized polypeptide chain. During the past decades a huge amount of thermodynamic data related to protein folding and stability has been accumulated. The data are certainly of importance in dechiffring the protein folding problem. At the same time, the data can guide the con­ struction of modified and newly synthesized proteins with properties optimized for particular application. The intention of this book is a generation of a data collection which makes the vast amount of present data accessible for multidisciplinary research where chemistry, phy­ sics, biology, and medicine are involved and also pharmaceutical and food research and technology. It took several years to compile all the data and the author wishes to thank everyone who provided data, ideas or even unpublished results. The author is, in particular, indebted to Prof. Wadso (Lund, Sweden) and IUPAC's Steering Committee on Bio­ physical Chemistry. Furthermore, support by the Deutsche Forschungsgemeinschafi (INK 16 AI-I) is acknowledged.